Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx3P23198 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx3P23198 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx3P23198 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx3P23198 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cbx3P23198 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx3P23198 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx3P23198 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx3P23198 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx3P23198 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx3P23198 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx3P23198 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx3P23198 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx3P23198 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx3P23198 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx3P23198 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx3P23198 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx3P23198 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx3P23198 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms