Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HmbsP22907 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HmbsP22907 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HmbsP22907 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HmbsP22907 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmbsP22907 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HmbsP22907 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HmbsP22907 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HmbsP22907 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HmbsP22907 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HmbsP22907 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HmbsP22907 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmbsP22907 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmbsP22907 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HmbsP22907 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HmbsP22907 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmbsP22907 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmbsP22907 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HmbsP22907 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HmbsP22907 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HmbsP22907 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HmbsP22907 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HmbsP22907 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmbsP22907 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HmbsP22907 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmbsP22907 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HmbsP22907 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmbsP22907 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmbsP22907 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmbsP22907 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmbsP22907 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmbsP22907 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HmbsP22907 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HmbsP22907 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HmbsP22907 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HmbsP22907 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HmbsP22907 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms