Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CA4P22748 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CA4P22748 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CA4P22748 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CA4P22748 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CA4P22748 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CA4P22748 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CA4P22748 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CA4P22748 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CA4P22748 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CA4P22748 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CA4P22748 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CA4P22748 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CA4P22748 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CA4P22748 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CA4P22748 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CA4P22748 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CA4P22748 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CA4P22748 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CA4P22748 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CA4P22748 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CA4P22748 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CA4P22748 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CA4P22748 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CA4P22748 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CA4P22748 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CA4P22748 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CA4P22748 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CA4P22748 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CA4P22748 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CA4P22748 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CA4P22748 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CA4P22748 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CA4P22748 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CA4P22748 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CA4P22748 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CA4P22748 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CA4P22748 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CA4P22748 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CA4P22748 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CA4P22748 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CA4P22748 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CA4P22748 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CA4P22748 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CA4P22748 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CA4P22748 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CA4P22748 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CA4P22748 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CA4P22748 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CA4P22748 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CA4P22748 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CA4P22748 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CA4P22748 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CA4P22748 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CA4P22748 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CA4P22748 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CA4P22748 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CA4P22748 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CA4P22748 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CA4P22748 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CA4P22748 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CA4P22748 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CA4P22748 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CA4P22748 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CA4P22748 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CA4P22748 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CA4P22748 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CA4P22748 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CA4P22748 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CA4P22748 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CA4P22748 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CA4P22748 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CA4P22748 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CA4P22748 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CA4P22748 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CA4P22748 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CA4P22748 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CA4P22748 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CA4P22748 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CA4P22748 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CA4P22748 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CA4P22748 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CA4P22748 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CA4P22748 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CA4P22748 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CA4P22748 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CA4P22748 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CA4P22748 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CA4P22748 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CA4P22748 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CA4P22748 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CA4P22748 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CA4P22748 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CA4P22748 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CA4P22748 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CA4P22748 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CA4P22748 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CA4P22748 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CA4P22748 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CA4P22748 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms