Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKACBP22694 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKACBP22694 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKACBP22694 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKACBP22694 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKACBP22694 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms