Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNOP22674 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNOP22674 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNOP22674 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNOP22674 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNOP22674 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNOP22674 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNOP22674 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNOP22674 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNOP22674 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNOP22674 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNOP22674 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNOP22674 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNOP22674 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNOP22674 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNOP22674 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNOP22674 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNOP22674 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNOP22674 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNOP22674 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNOP22674 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNOP22674 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNOP22674 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNOP22674 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNOP22674 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNOP22674 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNOP22674 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNOP22674 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNOP22674 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNOP22674 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNOP22674 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNOP22674 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNOP22674 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNOP22674 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNOP22674 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNOP22674 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNOP22674 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNOP22674 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNOP22674 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNOP22674 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNOP22674 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNOP22674 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNOP22674 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNOP22674 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNOP22674 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNOP22674 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNOP22674 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNOP22674 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNOP22674 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNOP22674 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNOP22674 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNOP22674 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNOP22674 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNOP22674 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNOP22674 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNOP22674 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNOP22674 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNOP22674 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNOP22674 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNOP22674 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNOP22674 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNOP22674 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNOP22674 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNOP22674 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNOP22674 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNOP22674 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNOP22674 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNOP22674 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNOP22674 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNOP22674 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNOP22674 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNOP22674 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNOP22674 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNOP22674 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNOP22674 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNOP22674 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNOP22674 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNOP22674 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNOP22674 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNOP22674 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNOP22674 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNOP22674 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNOP22674 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNOP22674 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNOP22674 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNOP22674 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNOP22674 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNOP22674 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNOP22674 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNOP22674 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNOP22674 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNOP22674 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNOP22674 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNOP22674 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNOP22674 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNOP22674 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNOP22674 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNOP22674 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNOP22674 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNOP22674 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms