Protein–RNA interactions for Protein: P22303

ACHE, Acetylcholinesterase, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACHEP22303 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACHEP22303 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACHEP22303 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACHEP22303 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACHEP22303 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACHEP22303 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACHEP22303 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACHEP22303 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACHEP22303 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACHEP22303 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACHEP22303 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACHEP22303 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACHEP22303 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACHEP22303 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACHEP22303 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACHEP22303 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACHEP22303 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACHEP22303 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACHEP22303 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACHEP22303 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ACHEP22303 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACHEP22303 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACHEP22303 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACHEP22303 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACHEP22303 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACHEP22303 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACHEP22303 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACHEP22303 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACHEP22303 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACHEP22303 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACHEP22303 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACHEP22303 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACHEP22303 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACHEP22303 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACHEP22303 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACHEP22303 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACHEP22303 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACHEP22303 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACHEP22303 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACHEP22303 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACHEP22303 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACHEP22303 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACHEP22303 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACHEP22303 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACHEP22303 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACHEP22303 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACHEP22303 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACHEP22303 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACHEP22303 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACHEP22303 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACHEP22303 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACHEP22303 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACHEP22303 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACHEP22303 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACHEP22303 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACHEP22303 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACHEP22303 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACHEP22303 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACHEP22303 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACHEP22303 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACHEP22303 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACHEP22303 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACHEP22303 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACHEP22303 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACHEP22303 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACHEP22303 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACHEP22303 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACHEP22303 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACHEP22303 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACHEP22303 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACHEP22303 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACHEP22303 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACHEP22303 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACHEP22303 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACHEP22303 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACHEP22303 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACHEP22303 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACHEP22303 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACHEP22303 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACHEP22303 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACHEP22303 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACHEP22303 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACHEP22303 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACHEP22303 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACHEP22303 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACHEP22303 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACHEP22303 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACHEP22303 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACHEP22303 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACHEP22303 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACHEP22303 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACHEP22303 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACHEP22303 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACHEP22303 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACHEP22303 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACHEP22303 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACHEP22303 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACHEP22303 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACHEP22303 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACHEP22303 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms