Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD9P21926 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD9P21926 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CD9P21926 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD9P21926 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD9P21926 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CD9P21926 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD9P21926 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CD9P21926 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD9P21926 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD9P21926 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD9P21926 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD9P21926 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CD9P21926 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CD9P21926 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CD9P21926 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD9P21926 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD9P21926 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD9P21926 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD9P21926 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD9P21926 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD9P21926 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD9P21926 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD9P21926 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CD9P21926 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD9P21926 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD9P21926 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD9P21926 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD9P21926 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD9P21926 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD9P21926 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD9P21926 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD9P21926 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD9P21926 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD9P21926 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD9P21926 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD9P21926 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD9P21926 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD9P21926 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD9P21926 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD9P21926 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD9P21926 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD9P21926 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD9P21926 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD9P21926 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD9P21926 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD9P21926 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD9P21926 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD9P21926 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CD9P21926 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CD9P21926 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CD9P21926 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD9P21926 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD9P21926 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD9P21926 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD9P21926 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD9P21926 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD9P21926 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD9P21926 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD9P21926 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD9P21926 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD9P21926 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD9P21926 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD9P21926 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD9P21926 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD9P21926 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD9P21926 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD9P21926 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CD9P21926 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD9P21926 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CD9P21926 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD9P21926 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD9P21926 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD9P21926 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD9P21926 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD9P21926 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD9P21926 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD9P21926 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD9P21926 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD9P21926 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD9P21926 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD9P21926 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD9P21926 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD9P21926 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD9P21926 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD9P21926 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD9P21926 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD9P21926 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD9P21926 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD9P21926 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD9P21926 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD9P21926 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD9P21926 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD9P21926 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD9P21926 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD9P21926 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD9P21926 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD9P21926 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD9P21926 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD9P21926 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms