Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6AP20340 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB6AP20340 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6AP20340 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6AP20340 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6AP20340 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6AP20340 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms