Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SDSP20132 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SDSP20132 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SDSP20132 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SDSP20132 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SDSP20132 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SDSP20132 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SDSP20132 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SDSP20132 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SDSP20132 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SDSP20132 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SDSP20132 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SDSP20132 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SDSP20132 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SDSP20132 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SDSP20132 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SDSP20132 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SDSP20132 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SDSP20132 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SDSP20132 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SDSP20132 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SDSP20132 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SDSP20132 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SDSP20132 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SDSP20132 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SDSP20132 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SDSP20132 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SDSP20132 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SDSP20132 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SDSP20132 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SDSP20132 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SDSP20132 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SDSP20132 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SDSP20132 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SDSP20132 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SDSP20132 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SDSP20132 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SDSP20132 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SDSP20132 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SDSP20132 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SDSP20132 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SDSP20132 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SDSP20132 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SDSP20132 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SDSP20132 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SDSP20132 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SDSP20132 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SDSP20132 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SDSP20132 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SDSP20132 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SDSP20132 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SDSP20132 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SDSP20132 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SDSP20132 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SDSP20132 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SDSP20132 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SDSP20132 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SDSP20132 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SDSP20132 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SDSP20132 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SDSP20132 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SDSP20132 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SDSP20132 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SDSP20132 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SDSP20132 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SDSP20132 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SDSP20132 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SDSP20132 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SDSP20132 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SDSP20132 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SDSP20132 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SDSP20132 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SDSP20132 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SDSP20132 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SDSP20132 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SDSP20132 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SDSP20132 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SDSP20132 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SDSP20132 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SDSP20132 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SDSP20132 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SDSP20132 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SDSP20132 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SDSP20132 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SDSP20132 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SDSP20132 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SDSP20132 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SDSP20132 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SDSP20132 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SDSP20132 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SDSP20132 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SDSP20132 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SDSP20132 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SDSP20132 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SDSP20132 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SDSP20132 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SDSP20132 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SDSP20132 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SDSP20132 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SDSP20132 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms