Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL3P19876 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL3P19876 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL3P19876 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL3P19876 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL3P19876 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL3P19876 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL3P19876 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL3P19876 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL3P19876 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL3P19876 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL3P19876 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL3P19876 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL3P19876 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL3P19876 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL3P19876 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.9 ms