Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
RXRAP19793 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RXRAP19793 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RXRAP19793 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RXRAP19793 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RXRAP19793 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RXRAP19793 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RXRAP19793 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RXRAP19793 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RXRAP19793 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RXRAP19793 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RXRAP19793 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RXRAP19793 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RXRAP19793 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RXRAP19793 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RXRAP19793 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RXRAP19793 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RXRAP19793 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RXRAP19793 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
RXRAP19793 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RXRAP19793 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RXRAP19793 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RXRAP19793 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RXRAP19793 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RXRAP19793 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RXRAP19793 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RXRAP19793 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RXRAP19793 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RXRAP19793 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RXRAP19793 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RXRAP19793 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RXRAP19793 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
RXRAP19793 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RXRAP19793 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RXRAP19793 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RXRAP19793 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RXRAP19793 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RXRAP19793 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
RXRAP19793 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RXRAP19793 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RXRAP19793 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RXRAP19793 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RXRAP19793 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RXRAP19793 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RXRAP19793 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RXRAP19793 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
RXRAP19793 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RXRAP19793 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RXRAP19793 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RXRAP19793 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RXRAP19793 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RXRAP19793 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RXRAP19793 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RXRAP19793 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RXRAP19793 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RXRAP19793 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RXRAP19793 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RXRAP19793 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RXRAP19793 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RXRAP19793 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RXRAP19793 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RXRAP19793 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RXRAP19793 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RXRAP19793 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RXRAP19793 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RXRAP19793 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RXRAP19793 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RXRAP19793 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RXRAP19793 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RXRAP19793 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RXRAP19793 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RXRAP19793 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RXRAP19793 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RXRAP19793 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RXRAP19793 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RXRAP19793 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RXRAP19793 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RXRAP19793 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RXRAP19793 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RXRAP19793 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RXRAP19793 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RXRAP19793 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RXRAP19793 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RXRAP19793 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RXRAP19793 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RXRAP19793 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RXRAP19793 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RXRAP19793 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RXRAP19793 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RXRAP19793 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RXRAP19793 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RXRAP19793 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RXRAP19793 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RXRAP19793 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RXRAP19793 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RXRAP19793 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RXRAP19793 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RXRAP19793 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RXRAP19793 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RXRAP19793 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms