Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cox5bP19536 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cox5bP19536 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cox5bP19536 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cox5bP19536 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cox5bP19536 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cox5bP19536 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cox5bP19536 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cox5bP19536 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cox5bP19536 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cox5bP19536 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cox5bP19536 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cox5bP19536 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cox5bP19536 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cox5bP19536 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cox5bP19536 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cox5bP19536 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cox5bP19536 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cox5bP19536 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cox5bP19536 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cox5bP19536 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cox5bP19536 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms