Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ms4a1P19437 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ms4a1P19437 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ms4a1P19437 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ms4a1P19437 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ms4a1P19437 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ms4a1P19437 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ms4a1P19437 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ms4a1P19437 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ms4a1P19437 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ms4a1P19437 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ms4a1P19437 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ms4a1P19437 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ms4a1P19437 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ms4a1P19437 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ms4a1P19437 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ms4a1P19437 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ms4a1P19437 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ms4a1P19437 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a1P19437 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a1P19437 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a1P19437 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a1P19437 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ms4a1P19437 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ms4a1P19437 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ms4a1P19437 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ms4a1P19437 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ms4a1P19437 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ms4a1P19437 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ms4a1P19437 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ms4a1P19437 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ms4a1P19437 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ms4a1P19437 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ms4a1P19437 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ms4a1P19437 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ms4a1P19437 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ms4a1P19437 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ms4a1P19437 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms