Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2CP19387 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2CP19387 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2CP19387 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2CP19387 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2CP19387 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2CP19387 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2CP19387 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms