Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd48P18181 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd48P18181 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cd48P18181 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd48P18181 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd48P18181 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd48P18181 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd48P18181 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd48P18181 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd48P18181 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd48P18181 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd48P18181 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd48P18181 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd48P18181 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd48P18181 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd48P18181 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd48P18181 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd48P18181 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cd48P18181 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cd48P18181 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd48P18181 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd48P18181 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd48P18181 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd48P18181 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd48P18181 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd48P18181 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd48P18181 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cd48P18181 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd48P18181 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd48P18181 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd48P18181 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd48P18181 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd48P18181 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd48P18181 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd48P18181 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd48P18181 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms