Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGR1P18146 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGR1P18146 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGR1P18146 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGR1P18146 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGR1P18146 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGR1P18146 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGR1P18146 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGR1P18146 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGR1P18146 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGR1P18146 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGR1P18146 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGR1P18146 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGR1P18146 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGR1P18146 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGR1P18146 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR1P18146 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR1P18146 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR1P18146 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR1P18146 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR1P18146 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR1P18146 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGR1P18146 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGR1P18146 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGR1P18146 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGR1P18146 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGR1P18146 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGR1P18146 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGR1P18146 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EGR1P18146 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGR1P18146 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGR1P18146 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGR1P18146 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGR1P18146 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGR1P18146 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGR1P18146 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGR1P18146 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGR1P18146 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGR1P18146 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGR1P18146 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGR1P18146 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EGR1P18146 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGR1P18146 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGR1P18146 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGR1P18146 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR1P18146 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR1P18146 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR1P18146 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR1P18146 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR1P18146 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR1P18146 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR1P18146 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR1P18146 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR1P18146 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR1P18146 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR1P18146 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR1P18146 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGR1P18146 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGR1P18146 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGR1P18146 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGR1P18146 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGR1P18146 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGR1P18146 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGR1P18146 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGR1P18146 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGR1P18146 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EGR1P18146 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGR1P18146 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGR1P18146 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EGR1P18146 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGR1P18146 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EGR1P18146 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGR1P18146 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGR1P18146 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EGR1P18146 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGR1P18146 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGR1P18146 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGR1P18146 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGR1P18146 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGR1P18146 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EGR1P18146 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGR1P18146 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGR1P18146 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGR1P18146 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGR1P18146 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EGR1P18146 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGR1P18146 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGR1P18146 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGR1P18146 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGR1P18146 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EGR1P18146 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGR1P18146 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGR1P18146 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGR1P18146 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGR1P18146 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGR1P18146 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR1P18146 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR1P18146 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR1P18146 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR1P18146 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms