Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb1P17919 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb1P17919 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb1P17919 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb1P17919 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb1P17919 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb1P17919 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxb1P17919 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms