Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTRB1P17538 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTRB1P17538 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTRB1P17538 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTRB1P17538 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTRB1P17538 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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