Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spi1P17433 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Spi1P17433 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spi1P17433 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spi1P17433 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spi1P17433 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spi1P17433 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spi1P17433 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spi1P17433 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spi1P17433 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spi1P17433 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spi1P17433 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spi1P17433 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spi1P17433 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spi1P17433 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Spi1P17433 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spi1P17433 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spi1P17433 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spi1P17433 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spi1P17433 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spi1P17433 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spi1P17433 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spi1P17433 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spi1P17433 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spi1P17433 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Spi1P17433 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spi1P17433 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms