Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPCAMP16422 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPCAMP16422 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EPCAMP16422 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPCAMP16422 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPCAMP16422 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EPCAMP16422 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPCAMP16422 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPCAMP16422 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EPCAMP16422 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPCAMP16422 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPCAMP16422 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPCAMP16422 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPCAMP16422 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPCAMP16422 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPCAMP16422 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPCAMP16422 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPCAMP16422 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPCAMP16422 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EPCAMP16422 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPCAMP16422 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EPCAMP16422 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms