Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHN1P15882 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHN1P15882 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHN1P15882 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHN1P15882 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHN1P15882 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHN1P15882 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHN1P15882 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHN1P15882 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHN1P15882 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHN1P15882 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHN1P15882 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHN1P15882 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHN1P15882 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHN1P15882 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHN1P15882 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHN1P15882 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHN1P15882 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHN1P15882 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHN1P15882 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHN1P15882 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHN1P15882 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHN1P15882 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHN1P15882 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHN1P15882 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHN1P15882 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHN1P15882 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHN1P15882 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHN1P15882 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHN1P15882 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHN1P15882 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHN1P15882 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHN1P15882 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHN1P15882 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHN1P15882 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHN1P15882 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHN1P15882 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHN1P15882 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHN1P15882 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHN1P15882 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHN1P15882 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHN1P15882 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHN1P15882 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHN1P15882 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHN1P15882 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHN1P15882 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHN1P15882 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHN1P15882 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHN1P15882 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHN1P15882 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHN1P15882 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHN1P15882 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHN1P15882 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHN1P15882 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHN1P15882 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHN1P15882 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHN1P15882 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHN1P15882 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHN1P15882 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHN1P15882 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHN1P15882 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHN1P15882 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHN1P15882 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHN1P15882 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHN1P15882 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHN1P15882 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHN1P15882 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHN1P15882 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHN1P15882 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHN1P15882 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHN1P15882 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHN1P15882 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHN1P15882 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHN1P15882 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHN1P15882 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHN1P15882 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHN1P15882 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHN1P15882 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHN1P15882 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHN1P15882 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHN1P15882 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHN1P15882 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHN1P15882 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHN1P15882 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHN1P15882 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHN1P15882 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHN1P15882 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHN1P15882 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHN1P15882 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHN1P15882 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHN1P15882 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHN1P15882 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHN1P15882 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHN1P15882 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHN1P15882 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHN1P15882 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHN1P15882 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHN1P15882 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHN1P15882 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHN1P15882 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms