Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
VEGFAP15692 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VEGFAP15692 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
VEGFAP15692 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
VEGFAP15692 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VEGFAP15692 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
VEGFAP15692 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
VEGFAP15692 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
VEGFAP15692 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
VEGFAP15692 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
VEGFAP15692 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
VEGFAP15692 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
VEGFAP15692 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
VEGFAP15692 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
VEGFAP15692 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
VEGFAP15692 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
VEGFAP15692 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
VEGFAP15692 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
VEGFAP15692 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
VEGFAP15692 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
VEGFAP15692 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
VEGFAP15692 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
VEGFAP15692 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms