Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim30aP15533 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim30aP15533 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim30aP15533 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim30aP15533 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim30aP15533 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim30aP15533 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30aP15533 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30aP15533 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30aP15533 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30aP15533 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30aP15533 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim30aP15533 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim30aP15533 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim30aP15533 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim30aP15533 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim30aP15533 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim30aP15533 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim30aP15533 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim30aP15533 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim30aP15533 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim30aP15533 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim30aP15533 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim30aP15533 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim30aP15533 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms