Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF2P15336 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF2P15336 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF2P15336 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF2P15336 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF2P15336 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF2P15336 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF2P15336 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF2P15336 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF2P15336 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF2P15336 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF2P15336 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF2P15336 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF2P15336 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF2P15336 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF2P15336 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF2P15336 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATF2P15336 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF2P15336 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF2P15336 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF2P15336 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF2P15336 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF2P15336 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF2P15336 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF2P15336 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF2P15336 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF2P15336 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF2P15336 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF2P15336 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF2P15336 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF2P15336 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF2P15336 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF2P15336 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF2P15336 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF2P15336 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF2P15336 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF2P15336 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF2P15336 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF2P15336 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF2P15336 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF2P15336 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF2P15336 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF2P15336 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF2P15336 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF2P15336 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF2P15336 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF2P15336 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF2P15336 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF2P15336 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF2P15336 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF2P15336 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF2P15336 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF2P15336 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF2P15336 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF2P15336 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF2P15336 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF2P15336 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF2P15336 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF2P15336 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF2P15336 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATF2P15336 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF2P15336 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF2P15336 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF2P15336 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF2P15336 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF2P15336 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF2P15336 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF2P15336 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF2P15336 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF2P15336 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF2P15336 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF2P15336 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF2P15336 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF2P15336 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF2P15336 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF2P15336 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF2P15336 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF2P15336 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF2P15336 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF2P15336 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF2P15336 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF2P15336 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF2P15336 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF2P15336 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF2P15336 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATF2P15336 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATF2P15336 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATF2P15336 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATF2P15336 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF2P15336 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF2P15336 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF2P15336 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF2P15336 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF2P15336 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF2P15336 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF2P15336 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF2P15336 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF2P15336 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF2P15336 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF2P15336 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms