Protein–RNA interactions for Protein: P14780

MMP9, Matrix metalloproteinase-9, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP9P14780 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP9P14780 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP9P14780 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP9P14780 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP9P14780 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP9P14780 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP9P14780 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP9P14780 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP9P14780 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP9P14780 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP9P14780 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP9P14780 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP9P14780 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP9P14780 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP9P14780 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP9P14780 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP9P14780 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP9P14780 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP9P14780 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP9P14780 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP9P14780 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP9P14780 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP9P14780 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP9P14780 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP9P14780 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP9P14780 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP9P14780 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP9P14780 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP9P14780 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP9P14780 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP9P14780 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP9P14780 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP9P14780 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP9P14780 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP9P14780 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP9P14780 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP9P14780 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP9P14780 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP9P14780 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP9P14780 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP9P14780 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP9P14780 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP9P14780 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP9P14780 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP9P14780 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP9P14780 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP9P14780 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP9P14780 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP9P14780 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP9P14780 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP9P14780 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP9P14780 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP9P14780 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP9P14780 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP9P14780 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP9P14780 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP9P14780 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP9P14780 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP9P14780 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP9P14780 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP9P14780 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP9P14780 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP9P14780 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP9P14780 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP9P14780 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP9P14780 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP9P14780 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP9P14780 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP9P14780 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP9P14780 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP9P14780 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP9P14780 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP9P14780 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP9P14780 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP9P14780 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP9P14780 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP9P14780 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP9P14780 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP9P14780 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP9P14780 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP9P14780 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP9P14780 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP9P14780 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP9P14780 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP9P14780 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP9P14780 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP9P14780 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP9P14780 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP9P14780 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP9P14780 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MMP9P14780 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP9P14780 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP9P14780 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP9P14780 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP9P14780 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP9P14780 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP9P14780 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP9P14780 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP9P14780 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP9P14780 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms