Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID1P14543 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID1P14543 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID1P14543 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID1P14543 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID1P14543 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NID1P14543 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID1P14543 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID1P14543 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID1P14543 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID1P14543 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NID1P14543 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID1P14543 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NID1P14543 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID1P14543 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID1P14543 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID1P14543 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NID1P14543 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID1P14543 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID1P14543 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID1P14543 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID1P14543 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NID1P14543 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NID1P14543 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NID1P14543 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NID1P14543 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID1P14543 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID1P14543 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID1P14543 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID1P14543 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID1P14543 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NID1P14543 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NID1P14543 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID1P14543 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID1P14543 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NID1P14543 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID1P14543 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID1P14543 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID1P14543 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NID1P14543 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID1P14543 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID1P14543 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NID1P14543 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID1P14543 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID1P14543 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID1P14543 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID1P14543 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID1P14543 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID1P14543 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID1P14543 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID1P14543 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID1P14543 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID1P14543 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NID1P14543 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID1P14543 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID1P14543 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID1P14543 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID1P14543 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID1P14543 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID1P14543 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID1P14543 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID1P14543 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID1P14543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID1P14543 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID1P14543 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID1P14543 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NID1P14543 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID1P14543 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID1P14543 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID1P14543 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID1P14543 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID1P14543 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID1P14543 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID1P14543 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID1P14543 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID1P14543 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID1P14543 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NID1P14543 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NID1P14543 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID1P14543 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NID1P14543 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NID1P14543 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID1P14543 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID1P14543 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID1P14543 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID1P14543 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID1P14543 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID1P14543 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID1P14543 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID1P14543 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID1P14543 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID1P14543 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID1P14543 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID1P14543 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID1P14543 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID1P14543 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID1P14543 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID1P14543 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NID1P14543 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID1P14543 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms