Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG2P13727 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG2P13727 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG2P13727 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG2P13727 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG2P13727 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG2P13727 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG2P13727 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG2P13727 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG2P13727 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG2P13727 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG2P13727 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG2P13727 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG2P13727 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG2P13727 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG2P13727 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG2P13727 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG2P13727 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG2P13727 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG2P13727 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG2P13727 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG2P13727 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG2P13727 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG2P13727 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG2P13727 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG2P13727 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG2P13727 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG2P13727 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG2P13727 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG2P13727 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG2P13727 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG2P13727 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG2P13727 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG2P13727 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG2P13727 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG2P13727 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG2P13727 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG2P13727 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG2P13727 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG2P13727 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG2P13727 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG2P13727 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG2P13727 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG2P13727 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG2P13727 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG2P13727 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG2P13727 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG2P13727 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG2P13727 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG2P13727 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG2P13727 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG2P13727 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG2P13727 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG2P13727 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG2P13727 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG2P13727 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG2P13727 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG2P13727 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG2P13727 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG2P13727 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRG2P13727 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG2P13727 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG2P13727 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG2P13727 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG2P13727 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG2P13727 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG2P13727 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG2P13727 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG2P13727 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG2P13727 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG2P13727 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG2P13727 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG2P13727 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG2P13727 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG2P13727 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG2P13727 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG2P13727 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG2P13727 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG2P13727 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG2P13727 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG2P13727 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG2P13727 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG2P13727 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG2P13727 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG2P13727 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG2P13727 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG2P13727 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG2P13727 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG2P13727 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG2P13727 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG2P13727 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG2P13727 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG2P13727 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG2P13727 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG2P13727 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG2P13727 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG2P13727 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG2P13727 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG2P13727 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG2P13727 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms