Protein–RNA interactions for Protein: P13439

Umps, Uridine 5'-monophosphate synthase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UmpsP13439 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UmpsP13439 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UmpsP13439 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UmpsP13439 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UmpsP13439 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UmpsP13439 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UmpsP13439 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UmpsP13439 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UmpsP13439 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UmpsP13439 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UmpsP13439 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UmpsP13439 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UmpsP13439 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UmpsP13439 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UmpsP13439 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UmpsP13439 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UmpsP13439 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UmpsP13439 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UmpsP13439 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UmpsP13439 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UmpsP13439 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UmpsP13439 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UmpsP13439 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UmpsP13439 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UmpsP13439 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UmpsP13439 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UmpsP13439 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UmpsP13439 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UmpsP13439 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UmpsP13439 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UmpsP13439 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UmpsP13439 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UmpsP13439 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UmpsP13439 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UmpsP13439 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UmpsP13439 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UmpsP13439 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UmpsP13439 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UmpsP13439 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UmpsP13439 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UmpsP13439 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UmpsP13439 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.4 ms