Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl1P12850 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cxcl1P12850 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl1P12850 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl1P12850 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cxcl1P12850 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl1P12850 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl1P12850 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl1P12850 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcl1P12850 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl1P12850 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl1P12850 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl1P12850 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl1P12850 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl1P12850 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl1P12850 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms