Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHRNB1P11230 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNB1P11230 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNB1P11230 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNB1P11230 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB1P11230 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB1P11230 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNB1P11230 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNB1P11230 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNB1P11230 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNB1P11230 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNB1P11230 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNB1P11230 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNB1P11230 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNB1P11230 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms