Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLUP10909 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLUP10909 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLUP10909 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLUP10909 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLUP10909 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLUP10909 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLUP10909 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLUP10909 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLUP10909 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLUP10909 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLUP10909 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLUP10909 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLUP10909 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLUP10909 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLUP10909 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLUP10909 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLUP10909 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLUP10909 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLUP10909 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLUP10909 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLUP10909 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLUP10909 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLUP10909 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUP10909 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUP10909 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUP10909 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUP10909 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUP10909 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLUP10909 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUP10909 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUP10909 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUP10909 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLUP10909 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUP10909 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLUP10909 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLUP10909 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLUP10909 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLUP10909 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLUP10909 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLUP10909 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLUP10909 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLUP10909 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLUP10909 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLUP10909 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLUP10909 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLUP10909 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLUP10909 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLUP10909 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLUP10909 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLUP10909 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLUP10909 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLUP10909 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLUP10909 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLUP10909 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLUP10909 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLUP10909 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLUP10909 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLUP10909 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLUP10909 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLUP10909 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLUP10909 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLUP10909 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLUP10909 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLUP10909 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLUP10909 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLUP10909 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLUP10909 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLUP10909 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLUP10909 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLUP10909 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLUP10909 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLUP10909 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLUP10909 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLUP10909 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLUP10909 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLUP10909 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLUP10909 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLUP10909 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLUP10909 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLUP10909 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLUP10909 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLUP10909 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLUP10909 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLUP10909 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLUP10909 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLUP10909 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLUP10909 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLUP10909 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLUP10909 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLUP10909 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLUP10909 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLUP10909 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLUP10909 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLUP10909 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLUP10909 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLUP10909 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLUP10909 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLUP10909 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLUP10909 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms