Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRBP10828 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
THRBP10828 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THRBP10828 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THRBP10828 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THRBP10828 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THRBP10828 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THRBP10828 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THRBP10828 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THRBP10828 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THRBP10828 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THRBP10828 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRBP10828 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRBP10828 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRBP10828 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRBP10828 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRBP10828 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRBP10828 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THRBP10828 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
THRBP10828 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THRBP10828 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRBP10828 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRBP10828 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRBP10828 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRBP10828 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRBP10828 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRBP10828 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
THRBP10828 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRBP10828 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRBP10828 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRBP10828 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRBP10828 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRBP10828 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRBP10828 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRBP10828 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRBP10828 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRBP10828 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRBP10828 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRBP10828 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRBP10828 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRBP10828 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRBP10828 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRBP10828 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRBP10828 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRBP10828 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRBP10828 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRBP10828 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRBP10828 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRBP10828 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRBP10828 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRBP10828 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRBP10828 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRBP10828 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRBP10828 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
THRBP10828 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
THRBP10828 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRBP10828 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRBP10828 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRBP10828 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRBP10828 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRBP10828 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRBP10828 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRBP10828 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRBP10828 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRBP10828 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRBP10828 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRBP10828 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRBP10828 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRBP10828 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRBP10828 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRBP10828 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRBP10828 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRBP10828 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRBP10828 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THRBP10828 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRBP10828 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRBP10828 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRBP10828 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRBP10828 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRBP10828 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRBP10828 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRBP10828 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THRBP10828 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRBP10828 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRBP10828 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THRBP10828 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRBP10828 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRBP10828 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRBP10828 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRBP10828 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THRBP10828 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THRBP10828 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THRBP10828 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
THRBP10828 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRBP10828 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRBP10828 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRBP10828 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRBP10828 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRBP10828 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRBP10828 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms