Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf89P0DMQ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C8orf89P0DMQ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf89P0DMQ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8orf89P0DMQ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C8orf89P0DMQ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms