Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRGAP2BP0DMP2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRGAP2BP0DMP2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP2BP0DMP2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SRGAP2BP0DMP2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRGAP2BP0DMP2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP2BP0DMP2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SRGAP2BP0DMP2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP2BP0DMP2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP2BP0DMP2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP2BP0DMP2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms