Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMIM13P0DJ93 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM13P0DJ93 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM13P0DJ93 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM13P0DJ93 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms