Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC166P0CW27 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC166P0CW27 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC166P0CW27 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC166P0CW27 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC166P0CW27 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC166P0CW27 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC166P0CW27 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC166P0CW27 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC166P0CW27 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC166P0CW27 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC166P0CW27 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC166P0CW27 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC166P0CW27 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC166P0CW27 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC166P0CW27 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC166P0CW27 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC166P0CW27 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC166P0CW27 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC166P0CW27 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC166P0CW27 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC166P0CW27 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC166P0CW27 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms