Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF888P0CJ79 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF888P0CJ79 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF888P0CJ79 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF888P0CJ79 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF888P0CJ79 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF888P0CJ79 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF888P0CJ79 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF888P0CJ79 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF888P0CJ79 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF888P0CJ79 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF888P0CJ79 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF888P0CJ79 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF888P0CJ79 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF888P0CJ79 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF888P0CJ79 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF888P0CJ79 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF888P0CJ79 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF888P0CJ79 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF888P0CJ79 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF888P0CJ79 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF888P0CJ79 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF888P0CJ79 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF888P0CJ79 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF888P0CJ79 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF888P0CJ79 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF888P0CJ79 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF888P0CJ79 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF888P0CJ79 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms