Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC159P0C7I6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC159P0C7I6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC159P0C7I6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC159P0C7I6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC159P0C7I6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms