Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa9P09631 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa9P09631 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa9P09631 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa9P09631 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa9P09631 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa9P09631 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa9P09631 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa9P09631 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa9P09631 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxa9P09631 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxa9P09631 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa9P09631 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa9P09631 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa9P09631 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa9P09631 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa9P09631 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa9P09631 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa9P09631 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa9P09631 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxa9P09631 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa9P09631 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa9P09631 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa9P09631 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa9P09631 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa9P09631 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa9P09631 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa9P09631 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa9P09631 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa9P09631 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa9P09631 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxa9P09631 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa9P09631 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa9P09631 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa9P09631 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa9P09631 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa9P09631 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa9P09631 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa9P09631 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa9P09631 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa9P09631 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa9P09631 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa9P09631 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa9P09631 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.4 ms