Protein–RNA interactions for Protein: P09542

Myl3, Myosin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl3P09542 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myl3P09542 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myl3P09542 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myl3P09542 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myl3P09542 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myl3P09542 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Myl3P09542 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Myl3P09542 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myl3P09542 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myl3P09542 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myl3P09542 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myl3P09542 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myl3P09542 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myl3P09542 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myl3P09542 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myl3P09542 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myl3P09542 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myl3P09542 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myl3P09542 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myl3P09542 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Myl3P09542 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myl3P09542 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myl3P09542 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Myl3P09542 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Myl3P09542 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myl3P09542 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myl3P09542 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myl3P09542 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myl3P09542 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Myl3P09542 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myl3P09542 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myl3P09542 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myl3P09542 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myl3P09542 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myl3P09542 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Myl3P09542 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myl3P09542 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myl3P09542 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myl3P09542 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myl3P09542 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myl3P09542 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myl3P09542 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myl3P09542 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myl3P09542 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myl3P09542 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myl3P09542 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myl3P09542 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myl3P09542 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myl3P09542 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Myl3P09542 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Myl3P09542 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myl3P09542 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myl3P09542 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myl3P09542 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myl3P09542 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myl3P09542 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Myl3P09542 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myl3P09542 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Myl3P09542 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myl3P09542 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myl3P09542 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myl3P09542 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myl3P09542 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myl3P09542 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Myl3P09542 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myl3P09542 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Myl3P09542 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myl3P09542 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms