Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd3P09027 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd3P09027 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd3P09027 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd3P09027 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd3P09027 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd3P09027 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd3P09027 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd3P09027 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms