Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS17P08708 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS17P08708 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS17P08708 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS17P08708 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS17P08708 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS17P08708 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS17P08708 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS17P08708 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS17P08708 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS17P08708 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS17P08708 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS17P08708 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS17P08708 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS17P08708 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS17P08708 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS17P08708 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS17P08708 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS17P08708 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS17P08708 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS17P08708 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS17P08708 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS17P08708 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS17P08708 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS17P08708 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS17P08708 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS17P08708 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS17P08708 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS17P08708 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS17P08708 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS17P08708 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS17P08708 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS17P08708 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS17P08708 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS17P08708 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS17P08708 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS17P08708 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS17P08708 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS17P08708 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS17P08708 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS17P08708 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS17P08708 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS17P08708 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS17P08708 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS17P08708 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS17P08708 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS17P08708 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS17P08708 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS17P08708 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS17P08708 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPS17P08708 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPS17P08708 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPS17P08708 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPS17P08708 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPS17P08708 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPS17P08708 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS17P08708 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS17P08708 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS17P08708 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS17P08708 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS17P08708 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS17P08708 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS17P08708 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS17P08708 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS17P08708 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS17P08708 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS17P08708 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS17P08708 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS17P08708 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS17P08708 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS17P08708 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS17P08708 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS17P08708 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS17P08708 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS17P08708 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS17P08708 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS17P08708 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS17P08708 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS17P08708 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS17P08708 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS17P08708 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS17P08708 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS17P08708 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS17P08708 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS17P08708 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS17P08708 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS17P08708 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS17P08708 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS17P08708 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS17P08708 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS17P08708 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS17P08708 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS17P08708 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS17P08708 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS17P08708 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS17P08708 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS17P08708 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS17P08708 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS17P08708 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS17P08708 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms