Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD55P08174 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD55P08174 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD55P08174 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD55P08174 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD55P08174 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD55P08174 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD55P08174 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD55P08174 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD55P08174 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD55P08174 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD55P08174 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD55P08174 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD55P08174 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD55P08174 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD55P08174 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD55P08174 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD55P08174 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD55P08174 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD55P08174 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD55P08174 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD55P08174 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD55P08174 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD55P08174 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD55P08174 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD55P08174 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD55P08174 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD55P08174 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD55P08174 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD55P08174 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD55P08174 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD55P08174 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD55P08174 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD55P08174 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD55P08174 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD55P08174 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD55P08174 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD55P08174 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD55P08174 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD55P08174 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD55P08174 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD55P08174 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD55P08174 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD55P08174 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD55P08174 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD55P08174 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD55P08174 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD55P08174 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD55P08174 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD55P08174 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD55P08174 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD55P08174 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD55P08174 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD55P08174 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD55P08174 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD55P08174 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD55P08174 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD55P08174 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD55P08174 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD55P08174 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD55P08174 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD55P08174 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD55P08174 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD55P08174 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD55P08174 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD55P08174 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD55P08174 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD55P08174 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD55P08174 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD55P08174 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD55P08174 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD55P08174 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD55P08174 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD55P08174 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD55P08174 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD55P08174 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD55P08174 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD55P08174 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms