Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI1P08151 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI1P08151 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI1P08151 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI1P08151 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI1P08151 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI1P08151 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI1P08151 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI1P08151 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI1P08151 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI1P08151 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI1P08151 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI1P08151 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI1P08151 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
GLI1P08151 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GLI1P08151 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI1P08151 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI1P08151 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI1P08151 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI1P08151 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI1P08151 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI1P08151 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI1P08151 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI1P08151 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI1P08151 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI1P08151 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI1P08151 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI1P08151 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI1P08151 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI1P08151 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI1P08151 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI1P08151 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI1P08151 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI1P08151 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI1P08151 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI1P08151 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI1P08151 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI1P08151 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI1P08151 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI1P08151 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI1P08151 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GLI1P08151 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI1P08151 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI1P08151 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI1P08151 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI1P08151 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI1P08151 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI1P08151 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI1P08151 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI1P08151 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI1P08151 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI1P08151 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI1P08151 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI1P08151 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GLI1P08151 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GLI1P08151 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI1P08151 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI1P08151 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI1P08151 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GLI1P08151 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GLI1P08151 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI1P08151 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI1P08151 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI1P08151 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI1P08151 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI1P08151 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI1P08151 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI1P08151 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GLI1P08151 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GLI1P08151 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI1P08151 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI1P08151 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI1P08151 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI1P08151 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI1P08151 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI1P08151 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI1P08151 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI1P08151 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLI1P08151 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI1P08151 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI1P08151 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLI1P08151 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI1P08151 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLI1P08151 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLI1P08151 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLI1P08151 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI1P08151 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI1P08151 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLI1P08151 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLI1P08151 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI1P08151 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI1P08151 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI1P08151 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI1P08151 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI1P08151 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI1P08151 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI1P08151 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI1P08151 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI1P08151 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI1P08151 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms