Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSN3P07498 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSN3P07498 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSN3P07498 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSN3P07498 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSN3P07498 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSN3P07498 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSN3P07498 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSN3P07498 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSN3P07498 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSN3P07498 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSN3P07498 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSN3P07498 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSN3P07498 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSN3P07498 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSN3P07498 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSN3P07498 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSN3P07498 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSN3P07498 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSN3P07498 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSN3P07498 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSN3P07498 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSN3P07498 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSN3P07498 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSN3P07498 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSN3P07498 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSN3P07498 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSN3P07498 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSN3P07498 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSN3P07498 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSN3P07498 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSN3P07498 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSN3P07498 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSN3P07498 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSN3P07498 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSN3P07498 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSN3P07498 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSN3P07498 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSN3P07498 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSN3P07498 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSN3P07498 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSN3P07498 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSN3P07498 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSN3P07498 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSN3P07498 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN3P07498 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN3P07498 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN3P07498 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN3P07498 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN3P07498 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN3P07498 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN3P07498 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSN3P07498 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSN3P07498 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CSN3P07498 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSN3P07498 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSN3P07498 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSN3P07498 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSN3P07498 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSN3P07498 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN3P07498 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN3P07498 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN3P07498 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN3P07498 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSN3P07498 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSN3P07498 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSN3P07498 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSN3P07498 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSN3P07498 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CSN3P07498 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CSN3P07498 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSN3P07498 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CSN3P07498 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSN3P07498 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSN3P07498 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSN3P07498 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSN3P07498 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSN3P07498 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSN3P07498 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSN3P07498 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSN3P07498 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSN3P07498 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSN3P07498 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSN3P07498 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSN3P07498 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSN3P07498 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSN3P07498 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSN3P07498 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSN3P07498 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSN3P07498 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSN3P07498 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSN3P07498 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSN3P07498 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSN3P07498 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSN3P07498 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSN3P07498 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSN3P07498 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSN3P07498 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSN3P07498 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSN3P07498 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms