Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtrP07309 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtrP07309 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtrP07309 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtrP07309 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtrP07309 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtrP07309 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtrP07309 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtrP07309 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtrP07309 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtrP07309 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtrP07309 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtrP07309 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtrP07309 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtrP07309 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtrP07309 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtrP07309 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtrP07309 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtrP07309 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtrP07309 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtrP07309 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TtrP07309 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtrP07309 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtrP07309 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtrP07309 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtrP07309 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtrP07309 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtrP07309 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtrP07309 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtrP07309 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtrP07309 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtrP07309 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TtrP07309 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtrP07309 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtrP07309 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtrP07309 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtrP07309 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtrP07309 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtrP07309 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtrP07309 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtrP07309 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtrP07309 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtrP07309 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TtrP07309 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtrP07309 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtrP07309 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtrP07309 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtrP07309 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtrP07309 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtrP07309 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtrP07309 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtrP07309 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtrP07309 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtrP07309 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtrP07309 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtrP07309 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtrP07309 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TtrP07309 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtrP07309 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtrP07309 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtrP07309 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TtrP07309 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtrP07309 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtrP07309 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtrP07309 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtrP07309 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtrP07309 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtrP07309 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtrP07309 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtrP07309 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtrP07309 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtrP07309 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtrP07309 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtrP07309 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtrP07309 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtrP07309 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TtrP07309 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtrP07309 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtrP07309 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtrP07309 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtrP07309 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtrP07309 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtrP07309 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtrP07309 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtrP07309 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms