Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SparcP07214 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SparcP07214 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SparcP07214 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SparcP07214 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SparcP07214 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SparcP07214 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SparcP07214 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SparcP07214 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SparcP07214 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SparcP07214 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SparcP07214 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SparcP07214 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SparcP07214 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SparcP07214 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SparcP07214 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SparcP07214 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SparcP07214 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SparcP07214 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SparcP07214 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SparcP07214 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SparcP07214 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SparcP07214 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SparcP07214 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SparcP07214 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SparcP07214 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SparcP07214 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SparcP07214 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SparcP07214 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SparcP07214 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SparcP07214 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SparcP07214 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SparcP07214 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SparcP07214 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SparcP07214 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SparcP07214 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SparcP07214 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SparcP07214 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SparcP07214 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SparcP07214 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SparcP07214 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SparcP07214 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SparcP07214 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SparcP07214 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SparcP07214 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SparcP07214 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SparcP07214 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SparcP07214 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SparcP07214 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SparcP07214 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SparcP07214 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SparcP07214 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SparcP07214 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SparcP07214 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SparcP07214 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SparcP07214 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SparcP07214 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SparcP07214 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SparcP07214 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SparcP07214 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SparcP07214 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SparcP07214 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SparcP07214 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SparcP07214 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SparcP07214 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SparcP07214 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SparcP07214 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SparcP07214 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SparcP07214 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SparcP07214 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SparcP07214 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SparcP07214 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SparcP07214 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SparcP07214 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SparcP07214 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SparcP07214 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SparcP07214 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SparcP07214 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SparcP07214 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SparcP07214 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SparcP07214 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SparcP07214 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SparcP07214 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SparcP07214 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SparcP07214 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SparcP07214 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SparcP07214 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SparcP07214 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SparcP07214 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SparcP07214 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SparcP07214 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SparcP07214 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SparcP07214 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SparcP07214 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SparcP07214 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SparcP07214 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SparcP07214 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SparcP07214 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SparcP07214 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SparcP07214 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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