Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPOP07202 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPOP07202 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPOP07202 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPOP07202 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPOP07202 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPOP07202 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPOP07202 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPOP07202 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPOP07202 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPOP07202 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPOP07202 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPOP07202 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPOP07202 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPOP07202 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPOP07202 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPOP07202 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPOP07202 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPOP07202 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPOP07202 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPOP07202 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPOP07202 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPOP07202 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPOP07202 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPOP07202 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPOP07202 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPOP07202 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPOP07202 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPOP07202 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPOP07202 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPOP07202 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPOP07202 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPOP07202 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPOP07202 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TPOP07202 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPOP07202 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPOP07202 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPOP07202 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPOP07202 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPOP07202 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPOP07202 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPOP07202 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPOP07202 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPOP07202 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TPOP07202 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPOP07202 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPOP07202 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPOP07202 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPOP07202 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPOP07202 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPOP07202 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPOP07202 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPOP07202 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPOP07202 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPOP07202 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPOP07202 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TPOP07202 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPOP07202 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPOP07202 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPOP07202 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPOP07202 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPOP07202 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPOP07202 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPOP07202 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPOP07202 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPOP07202 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPOP07202 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPOP07202 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TPOP07202 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPOP07202 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPOP07202 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPOP07202 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPOP07202 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPOP07202 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPOP07202 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPOP07202 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPOP07202 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPOP07202 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPOP07202 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TPOP07202 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPOP07202 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPOP07202 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPOP07202 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPOP07202 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPOP07202 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPOP07202 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPOP07202 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPOP07202 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPOP07202 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPOP07202 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPOP07202 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPOP07202 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPOP07202 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPOP07202 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPOP07202 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPOP07202 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPOP07202 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPOP07202 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPOP07202 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPOP07202 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms