Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn3P06796 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn3P06796 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn3P06796 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn3P06796 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn3P06796 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn3P06796 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn3P06796 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csn3P06796 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn3P06796 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn3P06796 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csn3P06796 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn3P06796 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms