Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAVP06756 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGAVP06756 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGAVP06756 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAVP06756 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAVP06756 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAVP06756 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAVP06756 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAVP06756 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAVP06756 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAVP06756 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGAVP06756 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAVP06756 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAVP06756 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGAVP06756 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGAVP06756 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms